Управление МБОУ "Николаевская школа" осуществляется в соответствии с действующим законодательством и Уставом образовательного учреждения. Единоличным исполнительным органом общеобразовательного учреждения является руководитель общеобразовательного учреждения – директор, назначаемый управлением образования Симферопольского района в порядке, установленном Правительством Республики Крым. Коллегиальными органами управления образовательным учреждением являются общее собрание работников школы, педагогический совет школы, управляющий совет и попечительский совет, совет родителей и совет обучающихся, а также ученическое самоуправление.

Учреждение имеет структурное подразделение, являющееся дошкольным образовательным учреждением, осуществляющим в качестве основной цели своей деятельности образовательную деятельность по образовательным программам дошкольного образования, присмотр и уход за детьми: - детский сад "Морячок" Муниципального бюджетного образовательного учреждения "Николаевская школа" Симферопольского района Республики Крым, расположенный по адресу: 297846, Республика Крым, пгт Николаевка, ул. Октябрьской Революции, д. 23-А. Руководит структурным подразделением заместитель директора по дошкольному образованию Тришкина Нина Васильевна